1. 原核生物の系統分類と学名認定
2. 原核生物学名データベースにみる新規微生物の登録状況
   2.1　LPSNにみる新規微生物の登録状況（1980〜2007年）
   2.2　TOBAにみる新規微生物の登録状況（2001〜2007年）
3. 未知微生物資源探索は今―2001〜2007年の歩み
   3.1　SAR11系統群―地球上で最も数の多い細菌系統群
   3.2　Marine Group�T系統群―アンモニア酸化能を有する初のArchaea
   3.3　新門提案―Gemmatimonadetes門／Lentisphaerae門
   3.4　Rice cluster�T―淡水域環境におけるメタン生成のキープレーヤー
   3.5　Verrucomicrobia門／Acidobacteria門／Chloroflexi門

1. 遺伝子解析手法の進展
2. SSU rRNA遺伝子配列情報の蓄積
3. 現在確認されている未培養微生物門
4. rRNA配列を手掛かりに未培養微生物の機能を推定する
   4.1　対象とする生物の機能遺伝子を中心としたゲノム情報に着目する方法
   4.2　対象とする微生物の基質取込み能や基質資化能を分離培養せずに観察する方法
   4.3　何とかして培養までこぎ着けて機能を調べる方法
5. 16S rRNA遺伝子以外の指標からの視点
6. まとめ―今後の課題

1. ヒトを宿主として感染する微生物の特徴
2. ヒトに対する病原細菌
   2.1　病原遺伝子
   2.2　病原遺伝子と特異症状を起こす遺伝子ネットワーク―コレラの場合
3. 細菌遺伝子ネットワークから明らかになること
   3.1　菌の生態的特徴
   3.2　細菌属種の生物的特徴・分類
   3.3　病原遺伝子の起源と発現調節
   3.4　コロニゼーション、細菌叢形成の特性
4. 病原性への対処
   4.1　抗菌薬
   4.2　ワクチン
   4.3　細胞内寄生細菌への対処
5. まとめ

第1節　生体内の微生物資源

第2節　自然環境にみる微生物資源

第1節　感染性微生物

1. 抗生物質を含む生物活性物質研究の歴史と主な化合物
2. 新たな微生物資源を求めて
   2.1　資源環境からのアプローチ
   2.2　分離方法を工夫して得た新しい微生物資源からの生物活性物質
3. 真菌と放線菌の共同作業
4. ユニークな評価系を用いて近年発見された生物活性物質
   4.1　プラジエノライド
   4.2　プラテンシマイシン
   4.3　シスラブダンおよびノソコマイシン
5. 放線菌のゲノムと二次代謝産物生産の多様性
6. まとめ

第3節　トキシン

1. バクテリオシンと抗生物質の違い
2. 乳酸菌バクテリオシンの分類と生合成
3. バクテリオシンの作用機構
4. 新奇バクテリオシンの探索
5. 戦略物質としてのバクテリオシンの活用

1. 大腸は病気の発信源
   1.1　大腸がん促進に働く二次胆汁酸産生に関与する腸内常在菌に迫る
   1.2　潰瘍性大腸炎に関与する腸内常在菌に迫る
   1.3　肥満と腸内常在菌
2. プロバイオティクス機能開発の展開
   2.1　クローズアップされる腸内環境コントロール―ヒトの健康増進のカギ
   2.2　プロバイオティクスで腸内環境をコントロールする
3. プロバイオティクス機能研究の未来に向けて

第1節　文部科学省ナショナルバイオリソースプロジェクトにみる微生物資源戦略

1. OECDにおける生物資源センタータスクフォースの設置とアウトプット
   1.1　NBRC設立の駆動力となった東京会合と第1期タスクフォース
   1.2　第2期タスクフォースの課題とNBRC
2. NBRCの設立と目標
3. NBRCの生物遺伝資源
   3.1　標準微生物株の整備
   3.2　生物遺伝資源としての遺伝子材料の整備
   3.3　探索用微生物株の整備
4. NBRCの機能
   4.1　NBRCに求められる技術とその開発
   4.2　NBRCにおける品質マネジメントシステム
5. 微生物利用環境の整備
   5.1　産業利用を考慮した微生物資源の寄託受入れの多様化
   5.2　病原微生物への対応
   5.3　生物遺伝資源に関する情報環境の整備とデータベースの公開
   5.4　法令遵守への支援
   5.5　国内外の他機関との連携
6. まとめ

1. 健康と環境の研究に資する微生物資源の確保
2. 健康と環境の研究に資する微生物資源の収集・保存・提供
3. 微生物株のゲノムDNAの整備および提供
4. 危機的な状況にある微生物保存機関からの微生物株移管
5. 21世紀微生物研究を支えるために

1. 戦略的な資源としての病原真菌と病原放線菌
2. IFM菌株の特徴
3. 医薬や診断薬の資源としての病原真菌と病原放線菌
   3.1　診断薬や医薬資源としての病原真菌
   3.2　診断薬や医薬資源としての放線菌
4. 国際的な連携の必要性

1. 「農林水産省ジーンバンク事業」のグランドデザインとその微生物遺伝資源部門の胎動期
2. 「農林水産省ジーンバンク事業」とその微生物遺伝資源部門の誕生
3. 日本の微生物株保存機関における「農林水産省ジーンバンク事業」微生物遺伝資源部門の位置付け
4. 「農林水産省ジーンバンク事業」の第1期、2期事業における微生物遺伝資源部門の計画と進捗状況
5. 農林水産省の試験研究機関の独立行政法人化に伴う「農林水産省ジーンバンク事業」としての展開
6. 「農林水産省ジーンバンク事業」における微生物部門の推進状況

第1節　アジア地域の微生物研究ネットワークにおける戦略

1. 医薬品の起源
2. 欧米大手製薬企業の動向
3. 天然物創薬の拠点
4. アウトソーシング先とベンチャー企業の台頭
5. わが国のバイオテク企業との比較
6. 微生物資源とゲノム解析

1. 微生物の産業利用の歴史と現状
2. 微生物利用産業の実績と課題
3. 産業分野ごとの微生物資源の利用性
   3.1　医薬、農薬、動物薬野など
   3.2　食品
   3.3　その他の分野での微生物産業利用
4. 企業における微生物資源戦略
   4.1　医薬品を例にした微生物資源探索
   4.2　国際共同研究での戦略例

1. 日本微生物学連盟（FMS Japan）について
2. 国際的微生物資源アクセスについて
   2.1　WFCCの動き
   2.2　CBDを踏まえたWFCCの動き
   2.3　CBD発効後における各CCの対応
   2.4　日本におけるCBDに関する議論と保存機関ネットワークの現状
   2.5　菌株保存機関の今後
3. 国際微生物学協会連合（IUMS）
4. まとめ

1. 日本微生物株保存機関連盟の発足および活動
2. 日本微生物資源学会の設立とその活動
3. 日本微生物資源学会・微生物株カタログの発刊と微生物情報
4. ワールド・データ・センター（WDC）の役割

1. 微生物の分類体系
2. 新属・新種の命名提案
3. 新属・新種の記載項目
4. 学名のラテン語掲載
5. 学名の発表

1. 生物遺伝資源としての微生物
2. 微生物リソースは試薬ではない
3. 日本は微生物資源国
   3.1　生物多様性に関する条約による制限
   3.2　微生物リソースは増殖する
   3.3　研究契約等に基づく成果有体物の移転
   3.4　特許微生物の寄託
   3.5　BRC／CCへの寄託と生物遺伝資源寄託・譲渡同意書の重要性
   3.6　微生物リソースのBRC／CCからの入手

1. 生物兵器とバイオテロ
2. バイオセーフティレベル
3. 病原体等取扱いの法的規制：感染症法による特定病原体等の規制